Mikrofiltrasyon öncelikle şu alanları içerir: ilaç endüstrisi, gıda endüstrisi (jelatin, şarap, alkollü içkiler, meyve suyu, süt vb.), yüksek-saflıkta su, belediye kanalizasyonu, endüstriyel atık su, içme suyu, biyoteknoloji ve biyo-fermantasyon.
Ultrafiltrasyon başlangıçta atık su ve kanalizasyon arıtımında endüstriyel ultrafiltrasyonda kullanıldı. Son otuz yılda, ultrafiltrasyon teknolojisinin gelişmesiyle birlikte, artık gıda işleme, içecek endüstrisi, ilaç endüstrisi, biyolojik ajanlar, geleneksel Çin tıbbı preparatları, klinik tıp, boyama ve baskı atıksu arıtımı, gıda endüstrisi atıksu arıtımı, kaynak geri kazanımı ve çevre mühendisliği gibi çok sayıda alana uygulanmıştır.
Nanofiltrasyonun ana uygulamaları şunlardır: gıda endüstrisi, bitkilerin derin işlenmesi, içecek endüstrisi, tarım ürünlerinin derin işlenmesi, biyofarmasötikler, biyo-fermantasyon, ince kimyasallar ve çevre koruma endüstrisi.
Ters ozmoz (RO), gelişmiş, verimli ve enerji- tasarrufu sağlayan özellikleri nedeniyle ülke ekonomisinin çeşitli sektörlerinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Öncelikle su arıtımında ve ısıya- duyarlı maddelerin konsantrasyonunda uygulanır. Başlıca uygulama alanları şunlardır: gıda endüstrisi, süt endüstrisi, içecek endüstrisi, bitkinin derin işlenmesi (tarım ürünleri), biyofarmasötikler, biyo-fermantasyon, içme suyu hazırlama, saf su, ultra saf su, deniz suyu, acı suyun tuzdan arındırılması, enerji, elektronik, yarı iletken endüstrisi suyu, farmasötik proses suyu, farmasötik hazırlama suyu, enjeksiyon için su, steril ve pirojensiz saf su, yiyecek ve içecek endüstrisi, kimyasal ve diğer endüstriyel proses suyu, kazan su, yıkama suyu ve soğutma suyu.
Diğerleri: Yukarıda belirtilen yaygın olarak kullanılan dört membran ayırma prosesine ek olarak diyaliz, kontrollü salım, membran sensörleri, membran gaz ayırma ve sıvı membran ayırma yöntemleri de bulunmaktadır.